تتشكل هيئة الرقابة الشرعية لبنك المؤسسة العربية المصرفية-الجزائر من علماء في الشريعة الإسلامية والاقتصاد ممن لهم تخصص بالعلوم الشرعية والمعاملات الإسلامية والنظم الاقتصادية والقانونية والمصرفية وفهم كاف للعمليات البنكية. يتم تعيين أعضائها من طرف الجمعية العامة لمساهمي البنك باقتراح من مجلس الإدارة.
يتمثل دور هيئة الرقابة الشرعية في توجيه نشاطات البنك المتعلقة بالصيرفة الإسلامية ومراقبتها والإشراف عليها للتأكد من التزام إدارة البنك بأحكام ومبادئ الشريعة الإسلامية في المعاملات التي تجريها من خلال النافذة الإسلامية "البُراق".
تكون الآراء والقرارات المعتمدة من طرف الهيئة ملزمة لإدارة البنك وفقا للإطار المرجعي المحدد من طرف الهيئة الشرعية الوطنية للإفتاء للصناعة المالية الإسلامية.